1.   Любой человек очень многогранен, и у него есть как мысли, так и чувства. Критики упрекают РЭПТ за чрезмерное внимание к мыслительным процессам, в то время как чувства в работе не затрагиваются, что может привести к их подавлению и отрицанию.

2.   Вероятно, РЭПТ не подходит для работы с некоторыми клиентами — теми, у кого уже есть проблемы с чрезмерной интеллектуализацией, или теми, кто не способен логически рассуждать (например, маленькие дети, шизофреники, клиенты с определенными личностными расстройствами, клиенты с низким уровнем интеллекта).

3.   Многие когнитивно-поведенческие консультанты жалуются на скуку и профессиональное «выгорание», когда им приходится использовать одни и те же аргументы и доводы в работе со всеми клиентами.

4.   РЭПТ сложно использовать в своей работе тем консультантам, которые не настроены достаточно воинственно и в то же время не умеют быстро остывать и которых не привлекают жаркие споры и яростные схватки.

5.   Поскольку консультант играет достаточно активную и директивную роль и при этом довольно многословен, клиент может чувствовать с его стороны доминирование и подавление и при этом не брать на себя ответственность за результаты работы.